Trong 6 tháng đầu năm 2009 phát hiện gần 4,9% mẫu thịt lợn và 3,6% mẫu thịt gà, vịt có dư lượng kháng sinh vượt ngưỡng cho phép; 8,1 mẫu rau, quả có dư lượng bảo vệ thực vật vượt ngưỡng cho phép. Đặc biệt, một số nông dân vẫn sử dụng thuốc bảo vệ thực vật đặc biệt nguy hại, đã bị cấm như monitor, endosulfan...

Tại cuộc họp, các cơ quan chức năng thuộc Bộ NN-PTNT kiến nghị cần tập trung kiểm tra, giám sát chất lượng thực phẩm ngay từ nguồn đầu vào bao gồm giống, thức ăn chăn nuôi và thuốc thú y, đặc biệt là các chất cấm; nâng mức xử phạt vi phạm hành chính trong hoạt động về giống, thức ăn chăn nuôi hoặc thuốc thú y lên gấp 2 lần so với hiện nay.