Tuy nhiên, chi phí thức ăn chiếm 55%-63% tổng chi phí chăn nuôi bò sữa của người chăn nuôi, rất cao so với những nước chăn nuôi bò sữa khác. Do vậy, khi giá thức ăn tăng liên tục thời gian gần đây, đặc biệt cám và cỏ đã làm giá thành sữa đội lên quá cao.
Theo ông Nguyễn Văn Tủi, Phó ban Kinh tế Hội Nông dân TPHCM, giá thành của những hộ nuôi dưới 10 con (chiếm phần lớn hộ nuôi bò sữa TP) từ 6.500 đồng/kg khi thức ăn chưa tăng, nay vượt qua ngưỡng 8.000 đồng/kg.
Ngoài ra, đa số nông dân nuôi bò sữa cho rằng, trong hợp đồng của các công ty mua sữa có những điều khoản gây bất lợi cho bà con chăn nuôi như công ty được đơn phương chỉnh sửa hợp đồng theo hướng lợi cho mình.