Thủ tướng Chính phủ giao Bộ Thương mại và Tổ công tác điều hành xuất khẩu gạo trực tiếp điều hành lượng gạo xuất khẩu theo từng quý trong năm, trong đó cần chú trọng chỉ đạo việc tập trung giao dịch, ký hợp đồng và thực hiện giao hàng theo tiến độ thỏa thuận đối với các hợp đồng xuất khẩu có giá cả tốt và khối lượng lớn ở các thị trường truyền thống: Philippines, Indonesia, Cuba, Malaysia, Nhật Bản...
Ở một số thị trường khác, đáp ứng nhu cầu đa dạng về phẩm cấp gạo với phương thức giao hàng thích hợp; lưu ý giá bán phải phù hợp khung giá chỉ đạo của Hiệp hội Lương thực Việt Nam. Việc phân công giao hàng theo các hợp đồng ở các thị trường truyền thống do các thành viên Hiệp hội Lương thực Việt Nam cùng thỏa thuận thống nhất thực hiện.
Trong quá trình điều hành, nếu giá gạo trên thị trường trong nước biến động, ảnh hưởng đến mặt bằng giá chung, Bộ Thương mại và Tổ công tác điều hành xuất khẩu gạo cần chủ động xử lý kịp thời những vấn đề phát sinh hoặc kiến nghị Thủ tướng Chính phủ các biện pháp xử lý nếu vượt thẩm quyền các cơ quan.