Riêng với chỉ tiêu Salmonella, EColi (chủng O157:H7), Bộ Nông nghiệp và Môi trường có hướng dẫn cụ thể khi thực hiện lấy mẫu.
“Lấy mẫu của 3 lô hàng đầu tiên để kiểm tra, xét nghiệm. Nếu kết quả cả 3 lô hàng đều đạt yêu cầu, thì cứ 3 lô hàng tiếp theo lấy mẫu của 1 lô hàng ngẫu nhiên để kiểm tra xét nghiệm. Trường hợp phát hiện lô hàng không đạt yêu cầu thì lấy mẫu 3 lô hàng tiếp theo để kiểm tra, xét nghiệm”, bộ này lưu ý.
Ngoài ra cơ quan kiểm dịch động vật cửa khẩu kiểm tra thực trạng hàng hóa, lấy mẫu tại cửa khẩu, cấp giấy chứng nhận vận chuyển (mẫu 14b) để chủ hàng vận chuyển hàng về kho bảo quản sản phẩm động vật theo đề nghị của chủ hàng.
Trường hợp sản phẩm động vật không thể lấy mẫu tại cửa khẩu, cơ quan kiểm dịch cửa khẩu sẽ thực hiện kiểm tra thực trạng, lấy mẫu tại kho bảo quản sản phẩm động vật theo đề nghị của chủ hàng. Và chủ hàng chịu trách nhiệm về vận chuyển, bảo quản hàng hóa trong khi chờ kiểm dịch.
Riêng sản phẩm động vật đông lạnh phải được lưu giữ tại cửa khẩu đến khi có kết quả kiểm tra đạt yêu cầu.