Theo đó, theo quy định tại Bước 4 khoản 3 Mục IV Phần II Quy trình nghiệp vụ quản lý đối với nguyên vật liệu nhập khẩu để sản xuất hàng xuất khẩu ban hành kèm theo Quyết định 929/QĐ-TCHQ, công chức hải quan phải đóng dấu “Đã hoàn thuế”, “Không thu thuế” tờ khai loại hình nhập sản xuất xuất khẩu. Trong trường hợp tờ khai nhập khẩu phải thanh khoản nhiều lần chỉ phải đóng dấu “Đã hoàn thuế”, “Không thu thuế” một lần vào lần cuối cùng khi hoàn thành các thủ tục hoàn thuế, không thu thuế đối với số nguyên liệu thuộc tờ khai nhập khẩu đó.

Để tránh hoàn thuế nhiều lần trên một tờ khai, Tổng cục Hải quan yêu cầu cần lập bảng kê theo dõi trừ lùi mỗi lần hoàn thuế (không thu thuế) và ghi rõ trên tờ khai nhập khẩu về việc đã lập bảng kê theo dõi trừ lùi, lần làm thủ tục hoàn thuế (không thu thuế) cuối cùng sẽ đóng dấu “Đã hoàn thuế”, “Không thu thuế” trên tờ khai nhập khẩu.