Theo Cục Trồng trọt, kiểm tra 859 mẫu phân bón của 17 tỉnh, thành trong năm 2009 có 419 mẫu không đạt chất lượng. Các mẫu phân bón này vi phạm ở nhiều hình thức như điều kiện sản xuất không đạt, vi phạm nhãn mác, vi phạm về tiêu chuẩn chất lượng, không có giấy phép sản xuất...
Thứ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Bùi Bá Bổng đề nghị Cục Trồng trọt xem xét xây dựng quy chuẩn kỹ thuật quốc gia về phân bón, ít nhất là quy định về quy trình sản xuất phân bón để quản lý ngay từ gốc, không đợi khi sản phẩm ra thị trường thì mới kiểm tra, xử lý.