Theo biểu mẫu kê khai thuế TNDN ước tính trong năm, DN đã ước tính doanh thu, chi phí, lợi nhuận trước thuế và thuế TNDN phải nộp trong năm. Khi nhận được tờ khai của DN thì cơ quan thuế yêu cầu thuế TNDN ước tính phải tương xứng với doanh thu. Mà DN được hiểu thì thuế TNDN chỉ được tính sau khi DN có lợi nhuận và số thuế phải nộp = lợi nhuận trước thuế x thuế suất. Nếu cơ quan thuế ép DN phải ước nộp theo tỷ lệ doanh thu thì không hợp lý. Bởi vì như hiện nay trong điều kiện giá vật tư, nhiên liệu tăng, chi phí đầu vào lớn dẫn đến lợi nhuận thấp mà đôi khi DN còn đang trong giai đoạn phá sản.
Ví dụ như DN kinh doanh trong lĩnh vực vận tải, giá nhiên liệu tăng (từ 4.850 đ/lít - 7.500 đ/lít) tăng 25%, lãi suất ngân hàng từ 0,85% - 1,15%/tháng, trong khi đó cước vận tải lại không tăng. Nếu cứ áp dụng theo như cách tính của cơ quan thuế là phải ép DN nộp theo tỷ lệ % doanh thu. Vậy trong trường hợp DN lãi thì nộp thuế là điều tất nhiên còn trường hợp DN lỗ thì liệu Nhà nước có bù lỗ hay không?
Ngoài ra, hiện nay việc vay vốn ngân hàng đối với DNNVV là một vấn đề gặp rất nhiều khó khăn. Thủ tục thế chấp thì rườm rà, lãi suất ngân hàng từ 1% lên 1,15% kéo theo chi phí sản xuất kinh doanh tăng. Như thế chấp vay bằng bìa đỏ trước kia cần xác nhận của phòng quản lý đất đai của phường và công chứng nhưng hiện nay lại phải qua phòng tài nguyên môi trường của quận, huyện xác nhận. Thời gian từ phường lên đến quận mất 7 ngày trong khi DN rất cần vốn. Thời gian làm thủ tục kéo dài, mất cơ hội kinh doanh của DN.q
Vậy đề nghị là nên để cấp xã phường xác nhận còn bỏ phòng môi trường quận và công chứng đỡ được nhiều khâu, giảm được thời gian và chi phí cho DN.